El Salvador cuenta con dos terminales aéreas de pasajeros, la más conocida de ellas es el Aeropuerto Internacional San Óscar Romero, el segundo es el Aeropuerto Internacional de Ilopango.
Ambas estaciones reciben diariamente flujos de personas extranjeras y nacionales provenientes de otros países, por lo cual y atendiendo a las medidas sanitarias para la prevención del Covid-19, las autoridades del Ministerio de Salud junto a CEPA, realizan diariamente un proceso de descontaminación y sanitización de los espacios físicos.
Estas medidas buscan prevenir y disminuir cualquier contagio proveniente desde el exterior; es importante recalcar que gracias a las acciones que ejecuta el Gobierno de El Salvador, hasta la fecha no hay ningún caso confirmado ni bajo sospecha de la enfermedad.